Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZFHX3Q15911 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms