Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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