Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA2Q15822 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
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