Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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PRKD1Q15139 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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PRKD1Q15139 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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PRKD1Q15139 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
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PRKD1Q15139 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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PRKD1Q15139 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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PRKD1Q15139 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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PRKD1Q15139 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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PRKD1Q15139 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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PRKD1Q15139 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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PRKD1Q15139 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKD1Q15139 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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