Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL9A2Q14055 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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