Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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COL4A6Q14031 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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COL4A6Q14031 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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COL4A6Q14031 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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COL4A6Q14031 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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COL4A6Q14031 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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COL4A6Q14031 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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COL4A6Q14031 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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COL4A6Q14031 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
COL4A6Q14031 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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