Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EXOSC2Q13868 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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