Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA9Q13797 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA9Q13797 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms