Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGCGQ13326 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCGQ13326 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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