Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms