Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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