Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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NR1H3Q13133 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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NR1H3Q13133 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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NR1H3Q13133 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
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NR1H3Q13133 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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NR1H3Q13133 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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NR1H3Q13133 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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NR1H3Q13133 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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NR1H3Q13133 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NR1H3Q13133 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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