Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IFT88Q13099 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
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