Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
STRN3Q13033 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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