Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PTPN13Q12923 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PTPN13Q12923 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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