Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LOXL1Q08397 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms