Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DDR1Q08345 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDR1Q08345 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms