Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD51Q06609 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms