Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABPB1Q06547 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABPB1Q06547 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms