Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PSME1Q06323 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSME1Q06323 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms