Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
REG3AQ06141 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms