Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TOP2BQ02880 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms