Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPTBN1Q01082 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms