Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFAMQ00059 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms