Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2MP61081 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2MP61081 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2MP61081 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2MP61081 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2MP61081 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2MP61081 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2MP61081 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2MP61081 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2MP61081 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2MP61081 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2MP61081 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2MP61081 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2MP61081 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2MP61081 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2MP61081 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2MP61081 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2MP61081 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2MP61081 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms