Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRP54P61011 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRP54P61011 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRP54P61011 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SRP54P61011 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRP54P61011 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SRP54P61011 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRP54P61011 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRP54P61011 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRP54P61011 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRP54P61011 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRP54P61011 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRP54P61011 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRP54P61011 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SRP54P61011 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRP54P61011 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRP54P61011 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRP54P61011 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRP54P61011 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRP54P61011 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRP54P61011 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRP54P61011 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRP54P61011 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRP54P61011 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRP54P61011 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SRP54P61011 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRP54P61011 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRP54P61011 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRP54P61011 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRP54P61011 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRP54P61011 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRP54P61011 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRP54P61011 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms