Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPCS3P61009 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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