Protein–RNA interactions for Protein: P60983

GMFB, Glia maturation factor beta, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMFBP60983 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMFBP60983 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMFBP60983 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMFBP60983 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMFBP60983 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMFBP60983 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMFBP60983 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMFBP60983 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMFBP60983 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMFBP60983 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GMFBP60983 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMFBP60983 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMFBP60983 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMFBP60983 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMFBP60983 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMFBP60983 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMFBP60983 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMFBP60983 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMFBP60983 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMFBP60983 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMFBP60983 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMFBP60983 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMFBP60983 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GMFBP60983 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GMFBP60983 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GMFBP60983 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMFBP60983 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMFBP60983 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMFBP60983 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GMFBP60983 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMFBP60983 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMFBP60983 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMFBP60983 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMFBP60983 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMFBP60983 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GMFBP60983 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms