Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABP4P57796 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABP4P57796 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABP4P57796 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABP4P57796 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CABP4P57796 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABP4P57796 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABP4P57796 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABP4P57796 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABP4P57796 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABP4P57796 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABP4P57796 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABP4P57796 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABP4P57796 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABP4P57796 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABP4P57796 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABP4P57796 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CABP4P57796 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CABP4P57796 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CABP4P57796 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CABP4P57796 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CABP4P57796 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CABP4P57796 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CABP4P57796 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CABP4P57796 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CABP4P57796 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CABP4P57796 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CABP4P57796 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CABP4P57796 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CABP4P57796 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CABP4P57796 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CABP4P57796 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CABP4P57796 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CABP4P57796 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CABP4P57796 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CABP4P57796 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CABP4P57796 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CABP4P57796 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CABP4P57796 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CABP4P57796 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CABP4P57796 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CABP4P57796 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CABP4P57796 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CABP4P57796 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CABP4P57796 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CABP4P57796 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CABP4P57796 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CABP4P57796 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CABP4P57796 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABP4P57796 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABP4P57796 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABP4P57796 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABP4P57796 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABP4P57796 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABP4P57796 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABP4P57796 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABP4P57796 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABP4P57796 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CABP4P57796 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABP4P57796 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABP4P57796 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CABP4P57796 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABP4P57796 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CABP4P57796 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABP4P57796 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CABP4P57796 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABP4P57796 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABP4P57796 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABP4P57796 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABP4P57796 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABP4P57796 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABP4P57796 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CABP4P57796 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CABP4P57796 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CABP4P57796 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CABP4P57796 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CABP4P57796 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CABP4P57796 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CABP4P57796 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CABP4P57796 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CABP4P57796 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CABP4P57796 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CABP4P57796 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CABP4P57796 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CABP4P57796 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CABP4P57796 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CABP4P57796 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CABP4P57796 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CABP4P57796 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABP4P57796 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms