Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTCP1P56278 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTCP1P56278 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTCP1P56278 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTCP1P56278 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTCP1P56278 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTCP1P56278 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTCP1P56278 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTCP1P56278 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTCP1P56278 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTCP1P56278 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTCP1P56278 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTCP1P56278 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTCP1P56278 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTCP1P56278 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTCP1P56278 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MTCP1P56278 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
MTCP1P56278 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms