Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF143P52747 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF143P52747 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF143P52747 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF143P52747 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF143P52747 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF143P52747 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF143P52747 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF143P52747 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF143P52747 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF143P52747 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms