Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNA2P51530 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNA2P51530 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNA2P51530 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNA2P51530 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DNA2P51530 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNA2P51530 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNA2P51530 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNA2P51530 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DNA2P51530 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNA2P51530 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNA2P51530 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNA2P51530 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DNA2P51530 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNA2P51530 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNA2P51530 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNA2P51530 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNA2P51530 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNA2P51530 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNA2P51530 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNA2P51530 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNA2P51530 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNA2P51530 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DNA2P51530 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNA2P51530 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNA2P51530 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNA2P51530 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNA2P51530 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNA2P51530 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNA2P51530 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNA2P51530 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNA2P51530 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNA2P51530 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNA2P51530 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNA2P51530 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNA2P51530 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNA2P51530 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms