Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TAF6P49848 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF6P49848 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF6P49848 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF6P49848 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF6P49848 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF6P49848 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF6P49848 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF6P49848 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF6P49848 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF6P49848 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF6P49848 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF6P49848 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF6P49848 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF6P49848 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF6P49848 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF6P49848 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF6P49848 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF6P49848 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF6P49848 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF6P49848 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF6P49848 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF6P49848 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF6P49848 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF6P49848 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF6P49848 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TAF6P49848 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF6P49848 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF6P49848 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF6P49848 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF6P49848 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF6P49848 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF6P49848 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF6P49848 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF6P49848 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF6P49848 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF6P49848 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF6P49848 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF6P49848 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF6P49848 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF6P49848 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF6P49848 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF6P49848 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF6P49848 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF6P49848 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF6P49848 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF6P49848 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TAF6P49848 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF6P49848 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF6P49848 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF6P49848 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF6P49848 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF6P49848 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF6P49848 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF6P49848 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF6P49848 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF6P49848 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF6P49848 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF6P49848 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF6P49848 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF6P49848 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF6P49848 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF6P49848 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF6P49848 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF6P49848 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF6P49848 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF6P49848 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF6P49848 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF6P49848 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF6P49848 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TAF6P49848 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF6P49848 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF6P49848 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF6P49848 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF6P49848 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF6P49848 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF6P49848 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF6P49848 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF6P49848 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF6P49848 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF6P49848 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF6P49848 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF6P49848 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF6P49848 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF6P49848 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF6P49848 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TAF6P49848 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms