Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHKA1P46020 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHKA1P46020 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms