Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HOXD12P35452 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms