Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP6P35125 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP6P35125 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP6P35125 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP6P35125 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP6P35125 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP6P35125 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP6P35125 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP6P35125 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP6P35125 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP6P35125 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP6P35125 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP6P35125 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP6P35125 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP6P35125 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP6P35125 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP6P35125 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP6P35125 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP6P35125 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP6P35125 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP6P35125 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP6P35125 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP6P35125 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP6P35125 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP6P35125 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP6P35125 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP6P35125 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP6P35125 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP6P35125 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP6P35125 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP6P35125 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP6P35125 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP6P35125 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP6P35125 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP6P35125 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP6P35125 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP6P35125 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP6P35125 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP6P35125 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP6P35125 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP6P35125 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP6P35125 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP6P35125 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP6P35125 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP6P35125 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP6P35125 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP6P35125 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP6P35125 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP6P35125 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP6P35125 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP6P35125 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP6P35125 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP6P35125 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP6P35125 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP6P35125 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP6P35125 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP6P35125 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP6P35125 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP6P35125 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP6P35125 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP6P35125 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP6P35125 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP6P35125 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP6P35125 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP6P35125 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP6P35125 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP6P35125 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP6P35125 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP6P35125 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP6P35125 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP6P35125 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP6P35125 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP6P35125 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP6P35125 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP6P35125 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP6P35125 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP6P35125 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP6P35125 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP6P35125 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP6P35125 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP6P35125 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP6P35125 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP6P35125 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP6P35125 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP6P35125 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP6P35125 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP6P35125 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP6P35125 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP6P35125 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP6P35125 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP6P35125 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP6P35125 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP6P35125 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP6P35125 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP6P35125 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP6P35125 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP6P35125 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP6P35125 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP6P35125 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP6P35125 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms