Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SFNP31947 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SFNP31947 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SFNP31947 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SFNP31947 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SFNP31947 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SFNP31947 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SFNP31947 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SFNP31947 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SFNP31947 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SFNP31947 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SFNP31947 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SFNP31947 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SFNP31947 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SFNP31947 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SFNP31947 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SFNP31947 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SFNP31947 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SFNP31947 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SFNP31947 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SFNP31947 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SFNP31947 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SFNP31947 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SFNP31947 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SFNP31947 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SFNP31947 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SFNP31947 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SFNP31947 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SFNP31947 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SFNP31947 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SFNP31947 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFNP31947 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFNP31947 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFNP31947 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFNP31947 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFNP31947 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFNP31947 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFNP31947 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFNP31947 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFNP31947 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFNP31947 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFNP31947 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFNP31947 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFNP31947 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFNP31947 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFNP31947 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFNP31947 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFNP31947 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFNP31947 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFNP31947 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFNP31947 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SFNP31947 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFNP31947 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFNP31947 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFNP31947 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFNP31947 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFNP31947 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFNP31947 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFNP31947 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFNP31947 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SFNP31947 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFNP31947 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFNP31947 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFNP31947 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFNP31947 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFNP31947 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SFNP31947 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms