Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EPHA1P21709 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms