Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMNB1P20700 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNB1P20700 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms