Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRHP20396 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRHP20396 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRHP20396 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRHP20396 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRHP20396 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRHP20396 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRHP20396 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TRHP20396 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRHP20396 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRHP20396 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TRHP20396 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRHP20396 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRHP20396 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRHP20396 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRHP20396 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRHP20396 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRHP20396 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRHP20396 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRHP20396 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRHP20396 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRHP20396 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRHP20396 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TRHP20396 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRHP20396 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRHP20396 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRHP20396 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRHP20396 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TRHP20396 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TRHP20396 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRHP20396 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRHP20396 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRHP20396 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TRHP20396 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRHP20396 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRHP20396 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRHP20396 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRHP20396 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TRHP20396 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRHP20396 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRHP20396 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRHP20396 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRHP20396 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRHP20396 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRHP20396 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRHP20396 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRHP20396 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TRHP20396 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRHP20396 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRHP20396 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRHP20396 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRHP20396 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRHP20396 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRHP20396 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRHP20396 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRHP20396 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRHP20396 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRHP20396 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRHP20396 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRHP20396 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRHP20396 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRHP20396 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRHP20396 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TRHP20396 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRHP20396 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TRHP20396 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRHP20396 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRHP20396 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRHP20396 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TRHP20396 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRHP20396 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRHP20396 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRHP20396 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TRHP20396 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRHP20396 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRHP20396 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRHP20396 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRHP20396 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRHP20396 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRHP20396 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRHP20396 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRHP20396 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TRHP20396 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRHP20396 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRHP20396 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRHP20396 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRHP20396 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRHP20396 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRHP20396 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRHP20396 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRHP20396 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRHP20396 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRHP20396 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TRHP20396 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRHP20396 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRHP20396 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRHP20396 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRHP20396 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRHP20396 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRHP20396 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
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