Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGHV1-8P0DP01 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms