Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

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Length 1,744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C4BP0C0L5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
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