Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C4AP0C0L4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms