Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOC1P02654 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOC1P02654 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOC1P02654 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC1P02654 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC1P02654 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC1P02654 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC1P02654 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC1P02654 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC1P02654 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC1P02654 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC1P02654 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC1P02654 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC1P02654 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC1P02654 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC1P02654 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC1P02654 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC1P02654 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC1P02654 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC1P02654 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC1P02654 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC1P02654 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC1P02654 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC1P02654 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC1P02654 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOC1P02654 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms