Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPTA1P02549 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms