Protein–RNA interactions for Protein: P01571

IFNA17, Interferon alpha-17, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA17P01571 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA17P01571 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms