Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGFRP00533 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EGFRP00533 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EGFRP00533 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EGFRP00533 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EGFRP00533 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EGFRP00533 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EGFRP00533 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EGFRP00533 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EGFRP00533 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EGFRP00533 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EGFRP00533 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EGFRP00533 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EGFRP00533 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EGFRP00533 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EGFRP00533 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EGFRP00533 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EGFRP00533 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EGFRP00533 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EGFRP00533 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EGFRP00533 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EGFRP00533 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGFRP00533 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGFRP00533 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGFRP00533 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGFRP00533 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGFRP00533 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGFRP00533 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGFRP00533 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGFRP00533 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGFRP00533 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGFRP00533 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGFRP00533 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGFRP00533 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGFRP00533 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGFRP00533 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGFRP00533 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EGFRP00533 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGFRP00533 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGFRP00533 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGFRP00533 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGFRP00533 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGFRP00533 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGFRP00533 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGFRP00533 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGFRP00533 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGFRP00533 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGFRP00533 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGFRP00533 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGFRP00533 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGFRP00533 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGFRP00533 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EGFRP00533 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EGFRP00533 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGFRP00533 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGFRP00533 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGFRP00533 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGFRP00533 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGFRP00533 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGFRP00533 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGFRP00533 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EGFRP00533 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EGFRP00533 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EGFRP00533 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EGFRP00533 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EGFRP00533 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EGFRP00533 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EGFRP00533 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EGFRP00533 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EGFRP00533 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EGFRP00533 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EGFRP00533 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EGFRP00533 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EGFRP00533 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EGFRP00533 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EGFRP00533 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EGFRP00533 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EGFRP00533 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EGFRP00533 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EGFRP00533 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGFRP00533 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGFRP00533 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms