Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX7O95931 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX7O95931 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX7O95931 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX7O95931 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX7O95931 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX7O95931 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX7O95931 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX7O95931 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX7O95931 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX7O95931 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX7O95931 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX7O95931 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX7O95931 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX7O95931 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX7O95931 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX7O95931 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX7O95931 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CBX7O95931 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX7O95931 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX7O95931 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX7O95931 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX7O95931 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX7O95931 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX7O95931 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX7O95931 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX7O95931 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX7O95931 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX7O95931 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX7O95931 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX7O95931 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX7O95931 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX7O95931 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX7O95931 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX7O95931 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX7O95931 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX7O95931 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX7O95931 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBX7O95931 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBX7O95931 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX7O95931 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX7O95931 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX7O95931 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX7O95931 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX7O95931 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX7O95931 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX7O95931 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX7O95931 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX7O95931 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX7O95931 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX7O95931 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX7O95931 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX7O95931 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX7O95931 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX7O95931 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX7O95931 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX7O95931 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX7O95931 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX7O95931 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX7O95931 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX7O95931 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX7O95931 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX7O95931 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX7O95931 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBX7O95931 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms