Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms