Protein–RNA interactions for Protein: O60683

PEX10, Peroxisome biogenesis factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX10O60683 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX10O60683 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX10O60683 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX10O60683 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX10O60683 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX10O60683 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX10O60683 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX10O60683 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX10O60683 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX10O60683 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX10O60683 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX10O60683 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX10O60683 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX10O60683 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX10O60683 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX10O60683 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX10O60683 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX10O60683 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX10O60683 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX10O60683 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX10O60683 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX10O60683 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX10O60683 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX10O60683 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX10O60683 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX10O60683 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX10O60683 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX10O60683 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX10O60683 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX10O60683 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX10O60683 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX10O60683 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX10O60683 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX10O60683 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX10O60683 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX10O60683 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX10O60683 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX10O60683 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX10O60683 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX10O60683 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX10O60683 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX10O60683 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PEX10O60683 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX10O60683 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX10O60683 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX10O60683 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX10O60683 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX10O60683 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX10O60683 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX10O60683 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX10O60683 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX10O60683 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX10O60683 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX10O60683 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX10O60683 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX10O60683 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX10O60683 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX10O60683 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX10O60683 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX10O60683 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX10O60683 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX10O60683 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX10O60683 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX10O60683 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX10O60683 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX10O60683 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX10O60683 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX10O60683 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PEX10O60683 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PEX10O60683 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms